http://dba.stackexchange.com/questions/47842/mysql-error-2049-hy000-connection-using-old-pre-4-1-1-authentication-protoc
Workbench 6.3 에선 MySql 하위 호환성 문제로 접근이 안될 수 있다. 다른 설정 고치기 보단 다른 DB 툴 이용하면 가능할 수 있다. http://www.heidisql.com/